海拔400米以下的低矮石质山地，分南、北两线分布在区内。南线为钟山余脉由东向西排列；北线为与栖霞区交界处分布的诸山。区内丘陵虽成线状分布，但都是独立的山体，海拔高度都在100米上下。

　　富贵山 位于太平门内，隔城墙与紫金山西麓余脉龙膊子相接，古称龙尾坡。海拔86.1米，东西长约1公里，南北宽约300米，面积不足0.3平方公里。山体由浅灰色含砾长石石英砂岩所构成，山上树木茂盛。

　　九华山 原名覆舟山，又名龙舟山，以山体犹如一只倒置的木船而得名。南朝初年，因此山下临玄武湖改称玄武山。后来因在山南建有小九华寺，俗称小九华山，现通称九华山。位于太平门内侧，东接富贵山。山体狭长，山势略呈弧形，弧口朝南，由石英砂砾岩和页岩构成。面积不足0.3平方公里，海拔61米。

　　北极阁 原名鸡笼山，因山势浑圆，形似鸡笼而得名。明初，山上建有钦天监观象台，故又称钦天山。清初，山上重建北极阁后，俗称北极阁。山体由石英砂砾岩、砂岩构成，北麓有小片火山喷出岩。面积约0.3平方公里，海拔60米，是市区中部的重要制高点。山顶建有气象台。古为皇家华林园，有鸡鸣寺等名胜古迹。1990年辟为开放型文化公园，称北极阁公园。

　　红山 位于中央门外曹后路北侧。红山，本六朝胜地大壮观山，因陈武帝在此阅武，建“大壮观”于山上而得名，又因山体由红色砂岩构成，称红土山，现俗称红山。由大红山、小红山、放牛山、和尚山等山头组成，面积约0.5平方公里，主峰大红山海拔78.9米。民国时为荒野丘岗。解放后，植树造林，山林葱笼，现为红山森林动物园。

　　朝阳山 位于岔路口西北侧与栖霞区交界处。因半山腰有朝阳洞，洞内有石佛，山以洞得名。山体略呈向南开口的弧形，由砂岩和粉砂岩构成，海拔123米。

　　聚宝山 位于岔路口村北侧与栖霞区交界处。山上可开取石料、硫矿，土质较肥，树木茂盛，故名聚宝山。西南—东北走向，山体呈椭圆形，长0.7公里，宽0.5公里，由石灰岩构成，海拔124.3米。
杨坊山位于东杨坊东北与栖霞区交界处，山以村得名。东西走向，长约1.5公里，南北宽约0.7公里，海拔109米。山体由石灰岩构成，山上遍植松树。

　　李山脚山 位于环陵路下五旗侧。相传此山是古时小秦王挑来的，后被李姓占有，故名。海拔82米。

　　狮子山 位于仙鹤门西北。传说明朝时山上有一座石狮子，故名。山体低矮浑圆，海拔53米。